碳纤维用于碳纤维微电极的制作。在此应用中通常与5-7微米直径的单个碳纤维被密封在玻璃毛细管[4]。在毛细管的或者用环氧树脂密封并抛光制作成为碳纤维圆盘微电极，或纤维被切割成长度为75-150微米，制作成为碳纤维圆柱电极。碳纤维微电极使用，也可以在安培检测法（英语：Amperometry）或快速扫描循环伏安法（英语：Fast-scan cyclic voltammetry）检测生物化学信号。